为满足全国兽药监督执法以及社会公众查询需要，2011年11月，中国兽医药品监察所正式启动国家兽药基础信息查询系统（以下简称查询系统）建设，项目组多次深入生产企业及相关单位进行调研，对全国药政、药监、企业等单位广泛征求意见，在相关单位的协调配合下，经过两年努力，于2013年12月全面完成查询系统建设。
该系统于2012年8月完成I期建设，上线6个数据库（兽药生产企业GMP证书和兽药生产许可证、兽药产品批准文号、国内兽用生物制品批签发、进口生物制品批签发、化药监督抽检结果数据、生药监督抽检结果数据），2013年12月，完成了II期5个数据库（临床试验审批、国内新兽药注册、进口兽药注册、标签说明书、国家标准）的建设。
目前该系统包含11个数据库，约25.5万余条数据，涵盖了兽药生产企业、监督抽检、注册审批、标准等全部基础数据，系统中的数据相互关联、信息完整，可基本满足行业查询需要。