1.发酵剂的筛选和优化：发酵剂是指用于发酵过程中的微生物、酶或其他添加剂。研究人员可以通过筛选和优化发酵剂，选择适合特定饲料的菌种和酶，以提高发酵效果和饲料质量。
2.发酵条件的优化：发酵条件包括温度、湿度、pH值、通气等因素。通过优化发酵条件，可以调控菌种的生长和代谢活性，提高发酵饲料的效果和品质。
3.发酵饲料的功能性研究：发酵饲料中的微生物代谢产物具有一定的功能性，如抗氧化、抗菌、改善肠道健康等。研究人员可以探索发酵饲料中的功能性成分，以及其对动物生长性能和健康的影响。
4.发酵饲料的经济性研究：发酵饲料的成本和经济效益也是研究的重点之一。研究人员可以通过改进发酵工艺、降低发酵成本等方式，提高发酵饲料的经济性和可行性。
5.发酵饲料的应用研究：发酵饲料在不同动物种类和生长阶段的应用研究也是重要的方向。研究人员可以探索发酵饲料在不同动物中的效果和适用性，为养殖业提供具体的应用指导。
其中发酵菌的筛选和优化重点之一是研究多菌共生对提高发酵饲料的生产效率和效果,多菌共生是指在发酵饲料中同时添加多种有益菌种，通过它们之间的协同作用，提高发酵饲料的效果。以下是一些利用多菌共生提高发酵饲料效果的方法：
选择适宜的菌种：根据发酵饲料的特点和目标，选择适宜的菌种。常用的菌种有乳酸菌、酵母菌和放线菌等。不同菌种具有不同的功能，可以根据需要进行组合。
调整菌种比例：不同菌种之间的比例关系对发酵饲料的效果有重要影响。合理调整菌种比例，可以提高发酵饲料的品质和营养价值。
优化发酵条件：发酵饲料的温度、pH值、湿度等条件对菌种生长和代谢活动有影响。通过调整这些条件，可以促进菌种的生长和代谢，提高发酵饲料的效果。
添加辅助物质：在发酵过程中，适量添加一些辅助物质，如发酵促进剂、酶制剂和微量元素等，可以增强菌种的活性和发酵效果。
控制发酵时间：不同菌种的生长和代谢速度不同，因此需要控制好发酵时间，以保证发酵饲料的品质和稳定性。
管理发酵过程：在发酵过程中，需要密切监测发酵饲料的温度、气味、湿度等指标，及时调整发酵条件，以确保发酵饲料的质量。
通过以上方法，可以充分利用多菌共生的优势，提高发酵饲料的效果，增加其营养价值和利用率，减少饲料浪费，提高养殖效益。
目前在多菌共生研究方面取得的成果有：
杨慧等人（2019）研究了不同菌种组合对玉米秸秆发酵饲料的影响。结果表明，添加纤维素降解菌和酵母菌的组合可以显著提高发酵饲料的纤维素降解率和乳酸产量，同时降低挥发性脂肪酸的产量。
刘丽等人（2020）研究了不同菌种组合对豆粕发酵饲料的效果。结果显示，添加纤维素降解菌、淀粉降解菌和乳酸菌的组合可以显著提高发酵饲料的蛋白质降解率和酸度，同时降低挥发性脂肪酸的产量。
张晓等人（2021）研究了不同发酵条件对多菌共生发酵饲料的影响。结果表明，适宜的温度、pH值和湿度可以促进菌种的生长和代谢，提高发酵饲料的效果和品质。
赵明等人（2018）总结了多菌共生发酵饲料的优势和应用前景。研究表明，多菌共生发酵饲料可以提高饲料的营养价值和利用率，减少饲料浪费，同时具有环境友好和经济效益的特点。
多菌共生发酵的优势：多菌共生发酵可以利用不同菌种的互补作用，提高发酵饲料的效果。不同菌种具有不同的代谢特点和功能，可以互相促进和协同作用，增强发酵效果。例如，一些菌种可以分解复杂的饲料成分，释放出有益的营养物质；另一些菌种可以产生酶类和代谢产物，进一步改善饲料的品质。
多菌共生发酵的应用前景：多菌共生发酵饲料具有广阔的应用前景。它可以提高饲料的营养价值和利用率，减少饲料浪费，同时具有环境友好和经济效益的特点。多菌共生发酵饲料可以应用于多种动物的饲养中，如家禽、畜牧等。研究人员可以进一步探索多菌共生发酵饲料的功能性、经济性和应用范围，为养殖业提供一种可持续发展的解决方案。